沈阳农业大学生态学科起步于20世纪70年代后期，建立于1980年。1986年被国务院学位办批准为具有农业生态学硕士学位授予权的学科，1995年因学科目录调整为生态学硕士学位授予权学科，2010年被确定为沈阳农业大学重点培育学科，是我国农业高校中较早建立生态学科的院校之一。

本学科为创建具有农业高校特色的生态学，坚持以农业发展需要为己任，以农村急需解决问题为目标，以生物研究为基础，以农业研究为重点，以提高学科水平与创建重点学科为方向，致力于研究农业生态系统结构、功能与发展，探索区域开发中的生态经济问题，尤其在农业生态学领域中，紧密结合中国农业实践，在合理利用资源，保护生态环境的同时，促进农业的可持续发展，在我国农业走上良性循环的道路方面，取得了一定的成绩。